センターは、センター（福岡市）、有明海研究所（柳川市）、豊前海研究所（豊前市）及び内水面研究所（朝倉市）の４研究所で構成されています。
【所在地】
福岡県水産海洋技術センター
〒819-0165 福岡市西区今津1141-1（TEL092-806-0854、FAX092-806-5223）
福岡県水産海洋技術センター有明海研究所
〒832-0055 柳川市吉富町728-5（TEL0944-74-0530、FAX0944-72-6170）
福岡県水産海洋技術センター豊前海研究所
〒828-0022 豊前市大字宇島76-30（TEL0979-82-2151、FAX0979-82-5599）
福岡県水産海洋技術センター内水面研究所
〒838-1306 朝倉市山田2449（TEL0946-52-3218、FAX0946-52-3324）
福岡県水産資料館
〒819-0165 福岡市西区今津1141-1（TEL092-805-3311、FAXなし）
| 部所 | 課名 | 業務の概要 |
| 水産海洋技術 センター |
総務課 | 予算執行管理、施設管理、職員の人事・服務の事務 等 |
| 企画経営課 | 試験研究の総合企画、ＨＰ等による情報発信、水産経済研究、食育・魚食普及水産物の利用加工研究・指導、漁業経営研究、経営安定・向上に関する指導 等
※他部所の同種課題についても連携して研究 |
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| 資源情報課 | 魚類（マダイ、ケンサキイカ、トラフグなど）の資源管理・増殖、漁場造成研究 等
※他部所の同種課題についても連携して研究 |
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| 漁業環境課 | 漁場環境・赤潮監視、有害生物駆除対策、漁場保全研究 等 | |
| 浅海増殖課 | 貝類（アワビ、ハマグリなど）や甲殻類（クルマエビ、ガザミなど）の資源管理・増殖、カキ、アコヤガイなどの養殖技術開発、藻場造成・保全研究、フトモズク、アカモク等の藻類増養殖、魚病診断・防除対策 等 | |
| 有明海研究所 | のり養殖課 | ノリの養殖技術開発、病害対策、漁場環境・赤潮監視、漁場保全研究 等 |
| 資源増殖課 | 貝類（アサリ、タイラギ、サルボウなど）や甲殻類（クルマエビ、ガザミなど）の資源管理・増殖、漁場造成研究 等 | |
| 豊前海研究所 | 漁業資源課 | 魚類（サワラ、カレイなど）や甲殻類（クルマエビ、ガザミなど）の資源管理・増殖、漁場環境・赤潮監視、漁場造成研究 等 |
| 浅海増殖課 | 貝類（アサリ）の資源管理・増殖、カキの養殖技術開発 等 | |
| 内水面研究所 | 魚類（エツ、オイカワ、コイなど）の資源管理・増殖、養殖魚（コイ、アユなど）の魚病診断・防除対策、漁場環境監視、漁場保全研究 等 |
研究部、有明海研究所、豊前海研究所及び内水面研究所では、各海域・内水面の漁場や対象魚種、漁業の特徴に即した試験研究、普及指導を行っており、企画管理部では、センター全体の企画調整や県民への情報発信などの業務を行っています。
※各海域、内水面の漁場と漁業の特徴はこちら